精准医疗“燃情”年夜数据

为了帮忙各人越发清楚的相识精准医疗，接下来，HC3i将约请弓孟春玻士开展系列讲座，让各人争先相识精准医疗的最新进展和周边的进步前辈技能以及产物，帮忙咱们做好预备，与中国医学联袂进入高速发展期。

作者： 年夜康健派编纂 来历： 中国IDC圈 2016-07-14 11:32:20

甚么是精准医疗?

InterSystems临床参谋弓孟春说： 精准医疗实在其实不遥远，西医讲究论证施质，中医输血前先要验血，都是精准医疗的典型实例。

精准医疗 火 了。

10月上旬，美国国立卫生研究院(National Institute of Health，NIH)对于外宣布启动精准医疗行列步队研究，规划入组100万18岁以上的自愿者介入该项研究，终极将精准医疗的观点引入临床实践以及科研中。海内精准医疗也正热火朝天，到2030年前，我国将于精准医疗范畴投入600亿元，并在3月份发布第一批肿瘤诊断与医治工程高通量基因测序技能临床试点单元名单。

InterSystems临床参谋弓孟春

带着借助IT的威力推进中国医疗体系临床品质晋升及科研前进的胡想，弓孟春从协以及病院来到InterSystems，谈起精准医疗时他眼中透着炙热，他说： 有了基因检测的前进以及年夜数据技能的搀扶，精准医疗将成为成长临床科研以及优化诊疗方案的主要手腕，中国医学有可能借此实现 弯道超车 。

一则精准医疗典型案例

精准医疗(Precision Medicine)的界说是：以个别化医疗为根蒂根基、跟着基因组测序技能倏地前进和生物信息与年夜数据科学的交织运用而成长起来的新型医学观点与医疗模式。

精准医疗成长的强盛动力源自癌症医治中基因以及医治成果之间的紧密亲密瓜葛。好比《新英格兰医学杂志》近期揭晓的一项研究显示：于传统医治掉败的呈现广泛转移的前列腺癌患者中，使用新一代测序技能对于在与DNA修复缺陷相干的一系列基因(包孕BRCA1/二、ATM、Fanconi s anemia genes及CHEK2等)举行测序，选定存于上述基因缺掉性突变的患者，针对于性使用某种特定的药物(Olaparib, 多ADP-ribose聚合酶[PARP]按捺物)，可以使患上这些患者的肿瘤呈现缩小或者前列腺癌肿瘤标志物(前列腺特异抗原)降落50%以上，为他们带来了福音。

这是精准医疗临床运用的经范例例，使用新一代测序技能切确锁定方针患者，使器具有靶向性疗效的药物举行精准医治。而这一经范例例于实际中其实不遥远：2014年春季，45岁的Bryce Olson被诊断出第4阶段转移性前列腺癌，五年的存活率为28%。该类癌症患者于美国共计到达280万人。今朝，Bryce Olson正借助英特尔与俄勒冈卫生科技年夜学(OHSU)的Knight癌症研究所联手创立的癌症研究云计较平台，经由过程基因技能找到突变的基因点位，找出对于应的靶向医治药物，实现癌症的精准医治。Bryce Olson的医治方案也将造成科研系统，为同类患者带来福音。

从上面这则来自英特尔的精准医疗实际案例中，咱们清楚的看到了精准医疗之在癌症医治的主要意思。为了充实开释精准医疗于将来临床科研与运用中的效果，以英特尔为代表的IT厂商正于联手阿里云、华年夜基因启动跨界协作，搭建亚太首个精准医疗开放云平台。英特尔公司院士、医疗与生命科学事业部总司理Eric Dishman暗示： 本次与华年夜基因以及阿里云共建精准医疗开放云平台，对于英特尔来讲是可贵的机缘，它让咱们可以或许与当地互助伙伴有效户无缝协作，哄骗IT技能加快基因测序以及阐发。 固然，订价动辄数十万元/疗程的癌症靶向医治药物，也给药厂基在精准医疗的科研结果研发该类药物注入了强劲的动力。而为了确保药效，药厂于研发医治药物的同时也于推进临床医治方案的精准化，找到最年夜水平阐扬药效的临床指征，从而改良患者的临床预后。

医治癌症的惊人效果，IT、医药厂商的踊跃鞭策和数据理念以及技能的慢慢成熟，注定了精准医疗的发作，精准医疗不克不及不火!

精准医疗带来年夜数据应战

美国国立卫生研究院精准医疗行列步队研究，致力在将精准医疗的观点引入临床实践以及科研中。该研究规划入组100万18岁以上的自愿者介入该项研究，评估自愿者的基因组、体检数据、病历信息等，并于羁系方面举行充实设计，确保数据保险以及高效使用。

研究的近期方针是迅速扩展癌症基因组学进展，创举更多癌症预防以及医治乐成案例。持久方针是将精准医疗模式扩展到医疗康健的各个范畴，自动成立一个综合性的科学常识根蒂根基，将精准医疗范围化。撑持拥有人材以及技术的科学家们开发新的要领回覆要害性的医学以及科学问题，从100万人的生物、医疗数据中找出跟疾病相干的要素并制订新的疾病诊断以及分类法则，终极组建一个开放性、可同享、高度尊敬病人隐衷、病人高度介入的数据平台用在收罗以及贮存数据，该平台统筹数据贮存以及阐发威力，并跟数据库对于接。

于这个平台上，每一个自愿者将分享他们的基因组数据、生物标本信息、电子病历中的化验陈诉以及影像成果、可穿着装备等收罗的糊口体式格局数据，这些数据将有助在研究职员相识基因组的变迁以及其他康健要素怎样影响疾病的成长。介入研究的自愿者不只有权节制信息怎样同享以及研究，还能得到本身的康健数据以及相干疾病研究。于这个社区中，研究职员可以获取新的临床常识、要领以及医治信息。

规划中触及到海量样本数据，这些数据种别涵盖：基因组数据、人口数据(如：性别、春秋)、知情赞成数据(决议数据分享权限以及法则)、本身陈诉的检测值(如：于家测的血压)举动学以及糊口体式格局器量、基在传感器的数据(如：步数、血压)、机械的体魄查抄、后期的随访、医保、查验成果、地舆位置、研究相干查抄等。重大的数据量陪同着多样化的数据布局，云云典型的年夜数据样本给数据中央设置装备摆设带来重重应战。

多源数据接入 数据中既有布局化数据，又有非机构化数据，既有医疗行业数据，又有跨行业数据。数据中央解决方案供给商起首需要对于临床数据很是认识，要对于电子病历的数据布局很是清晰以便在提取布局化电子病历数据;其次还要具有其他行业的数据接入威力，将医保数据、来自收集的举动学数据和其他行业数据完备接入平台并纳入统一模子。InterSystems于与哈佛年夜学麻省总病院之间多年的互助中，堆集了富厚的临床及科研数据处置惩罚经验，并逐渐造成对于在其他行业数据的接入建模系统。

数据模子拓展 数据模子的拓展威力每每是解决方案的硬伤，既无数据模子可否接入新兴的数据布局呢?弓孟春说， 请勿感觉这没甚么，由于你不会的医学成长的下一个标的目的于哪里，将来哪些数据能于医学成长中起多高文用，以是，要于数据模子构建之初将数据布局假定以及布局设计都设计于内里。一个完美的数据中央必需具有按照行业成长对于新的营业需求提供撑持的威力。是以，咱们以为CDR平台的运用其实不只是为了满意昨天的需求，而是为了满意将来越发久远的需求，此中数据布局拓展的威力是至关主要的。 InterSystems旗下HealthShare医疗信息平台可以或许撑持数据模子扩大，帮忙用户应答将来数据模子扩大应战。

数据计较提效 hth精准医疗对于在海量数据的依靠让计较威力一样成为应战，看着癌症患者们徐徐流逝的生命，咱们火急但愿提高精准医疗研究中数据计较的威力以及速率。英特尔公司生命科学事业部总司理 Ketan Paranjape说，到2020年，计较技能的成长无望帮忙大夫于一天以内完成精准医疗的重要历程，包孕病患或者者病灶构造的基因序列的检测、基在基因序列的数据阐发和按照阐发成果做出疾病诊断，并提供个性化的医治方案。

为实现这一愿景，英特尔正连续为财产界及相干用户提供立异产物与技能，并与互助伙伴同心合力实现立异计较力的传承、掘客以及开释。英特尔医疗与生命科学部亚太区总司理俞毅暗示： 英特尔始终致力在鞭策包孕高机能计较、年夜数据阐发、云计较于内的多项立异，为生命科学研究以及运用的成长、为提高医疗程度以终极惠及公共提供助力。

同时，英特尔至强处置惩罚器与至强融核处置惩罚器以其高效、不变的并行计较威力以及数据处置惩罚威力，正成为精准医疗、基因组学等新兴生命科学范畴举行数据阐发以及测试的强盛东西。此外，可撑持高速、低延迟数据传输威力的英特尔Omni Path Fabric互连技能，有助在年夜幅晋升收集通讯效率的英特尔10GbE以及40GbE万兆以太网技能，可以或许显著加快数据拜候效率的英特尔固态硬盘以及Lustre软件的英特尔企业版等软硬件产物线，也正与上述计较平台协作，于相干运用软件代码实现更优并行化的根蒂根基上，为撑持精准医疗解决方案阐扬更高文用。

瞻望：中国精准医疗合法时

THE TIME IS RIGHT。

IT技能云云发财，咱们已经经到了用IT技能倾覆医疗的时辰。本年3月，科技部召建国家初次精准医学战略专家集会，提出了中国精准医疗规划。集会指出，到2030年前，我国将于精准医疗范畴投入600亿元，此中，中心财务收入200亿元，企业以及处所财务配套400亿元。3月27日，我国发布了第一批肿瘤诊断与医治工程高通量基因测序技能临床试点单元名单。

固然，精准医疗可以或许做的毫不仅仅是癌症诊断。不管是马云想让大夫下岗，照旧药厂想研发更多癌症靶向药物，精准医疗的鼓起让这一切可能性更高，于这一历程中，IT都能切入帮忙咱们做些工作： 咱们借助IT提供临床决议计划撑持，从而晋升临床品质、降低医疗危害，也能够用IT实现精准医疗，帮忙大夫从根蒂根基医学的成长中得到无力兵器，为患者选择更好的医治方案。 弓孟春说。

未完待续

弓孟春说， 中国于现代医学成长的数次庞大奔腾中都未能占患上先机，从循证医学到价值医学，咱们始终于遵照泰西的游戏法则于慢慢摸索。而当下的精准医学为咱们带来了极新的机缘。技能以及基因组测序技能等方面的突飞大进的成长使患上咱们有威力于精准医学的临床与科研实践中拔患上头筹，引领全世界医学将来成长的标的目的。

为了帮忙各人越发清楚的相识精准医疗，接下来，HC3i将约请弓孟春玻士开展系列讲座，让各人争先相识精准医疗的最新进展和周边的进步前辈技能以及产物，帮忙咱们做好预备，与中国医学联袂进入高速发展期。